本宮創建於清康熙四年，明永曆十九年 ( 西元 1665 年 ) ，為一傳統閩南式廟宇建築，格局恢弘秀麗，精緻典雅，是榮獲「國家薪傳獎」的福建省溪底派閩式廟宇大木匠師王錦木老先生所精心設計，他在榮獲「薪傳獎」發表談話時公開表示，三寮灣東隆宮是一座最能代表他溪底派整體建廟理念與風格的廟宇，也是他一生中最滿意的作品。
其他如門神彩繪：潘麗水先生，堵頭彩繪：李漢卿先生，廟脊剪黏：葉進祿、葉進益
先生，木部雕刻：蘇永欽先生等，皆是榮獲「國家薪傳獎」或名重一時的著名匠師，所以本宮堪稱集名家大成之經典廟宇建築傑作，而且本廟所用之建材，如觀音
石、台灣檜木、牛樟木等皆是道地本土所產，無參雜外來品，所以本廟亦是研究傳統台灣建築藝術之最佳所在。
本宮位於台南縣北門鄉三光村三寮灣。是濱海的一個小漁村。在三百三十八年前，先民由大陸渡海來台時，為保佑航海平安，特奉請故鄉神明 李府千歲金尊隨船保護渡台。來台後落腳於此，初搭建三間草寮安身，因三間草寮之間，道路彎曲，因而有「三寮灣」之稱而沿用至今。
先民們初來乍到，生活困苦，其奉請來台的 李府千歲金身，無處安座，只好置於工具籃中。爾後，因王爺神威顯赫，屢求必應，於數年後蓋草寮奉祀，供善信參拜。
從此，神威更顯，護佑生民，消災改厄，香火日盛。後來善信們為崇功報德，乃集資於民前十年（一九○二年）興建公厝型廟宇──慈安宮奉祀，此為「三寮灣東隆宮」的前身。
民國卅年，日人為箝制台胞思想，推行「皇民化運動」，嚴禁人民奉祀神佛，且大肆拆除寺廟，焚毀神像，當時全省各地被拆廟宇及焚毀神像不計其數。但日本警察目睹本官 李府千歲神功卓著，正氣昭彰，特法外相待，不敢造次，因此， 李府千歲金身得以保存至今。
民國卅四年初，東港束隆宮
溫府二千歲，奉旨鎮駐本宮濟世，從此，李、溫二府千歲，相輔相成，大展神威，南巡北狩，受惠善信遍及全省各地，廟譽日隆，香火更盛，外地善信感恩之餘，又
為方便就近奉祀參拜、庇佑，乃先後分靈建宮、設壇者有，台北、中和、板橋、高雄、五甲、鳳山等地。
民國卅四年，拆除公厝式舊廟重建，為答謝東港束隆宮 溫府二千歲輔助之恩，隨將廟額「慈安宮」易為「東隆宮」，成為本省第二開基東隆宮。
民國五十四年，因重建後已十餘年，部分建物略有損壞，丹青剝落，經全面整修後，廟貌煥然一新，金碧堂皇，為答謝上蒼、神佛之恩，於五十五年啟建三朝清醮。
民國五十九年，本宮為崇功報德，答謝神庥而崇體制，於十月再拆除廟宇重建，經八年後，於六十七年十月竣工慶成，是為今之廟貌。
廟內的保生大帝乃是一八九五年(清光緒二十一年)，本庄編入學甲堡後，庄民發起由學甲慈濟宮恭請 保生大帝神尊奉祀。
廟宇名稱；台南市北門區三寮灣東隆宮
廟宇地址：台南市北門區三光里三寮灣九五號 @23.23857, 120.11150
參拜時間：2013/11/29
